四川大学近年来努力构建科研创新体系，科学研究不断取得新突破，科研综合实力大幅度增强。科研总经费实现了逐年增加，2003年为4.0475亿元，2004年为5.5111亿元，2005年 为7.0154亿元，2006年为7.5亿，2007年学校科研总经费已达到8.5亿元，其中理、工、医科研总经费超过8亿元，人文社科科研经费达到  4927.8 万元。每年获国家自然科学基金项目百余项。2003年、2004年、2005年，谢和平院士、魏于全院士、顾忠伟教授相继成为国家“973计划”项目首席科学家；游志胜教授先后中标两项国防重大项目，左卫民教授、张衔教授、邓玲教授、蒋永穆教授先后获得4项国家社科基金重大招标项目，李天德教授获国家社科基金重大委托项目，杜肯堂教授获教育部人文社会科学重大招标项目；获准自然科学基金杰出青年基金总数达到35项。